در رشته مهندسی کامپیوتر، شبیه‌سازهای متعددی برای مدل‌سازی و شبیه‌سازی سیستم‌ها و فرآیندهای مختلف استفاده می‌شوند. این شبیه‌سازها به دانشجویان دکتری در تحلیل و بهینه‌سازی الگوریتم‌ها، شبکه‌ها، سیستم‌های توزیع‌شده و دیگر حوزه‌های مرتبط کمک می‌کنند. در زیر لیستی از 20 شبیه‌ساز پرکاربرد و مهم در انجام رساله‌های دکتری در مهندسی کامپیوتر آورده شده است:

1. MATLAB/Simulink

• شبیه‌ساز قدرتمند برای الگوریتم‌های محاسباتی، سیستم‌های کنترلی، پردازش سیگنال و شبکه‌های عصبی.

2. NS2 (Network Simulator 2)

• شبیه‌سازی شبکه‌های کامپیوتری، پروتکل‌های شبکه و شبکه‌های بی‌سیم.

3. NS3 (Network Simulator 3)

• نسخه پیشرفته NS2 برای شبیه‌سازی شبکه‌های پیچیده‌تر و فناوری‌های جدیدتر شبکه.

4. OMNeT++

• شبیه‌ساز شبکه‌های کامپیوتری و سیستم‌های توزیع‌شده برای تحقیقات در حوزه شبکه‌ها و اینترنت اشیا.

5. OPNET

• شبیه‌سازی شبکه‌های ارتباطی، مدیریت شبکه و ارزیابی عملکرد سیستم‌های شبکه.

6. GNS3 (Graphical Network Simulator 3)

• شبیه‌سازی شبکه‌های کامپیوتری برای تست و ارزیابی شبکه‌های فیزیکی و مجازی.

7. CloudSim

• شبیه‌سازی سیستم‌های رایانش ابری و ارزیابی عملکرد و مدیریت منابع در محیط‌های ابری.

8. Mininet

• شبیه‌ساز شبکه‌های نرم‌افزارمحور (SDN) و آزمایش محیط‌های شبکه‌ای مجازی.

9. Cooja (Contiki OS)

• شبیه‌سازی شبکه‌های حسگر بی‌سیم و اینترنت اشیا (IoT). شبیه‌سازهای مهم مهندسی کامپیوتر

10. Docker

• شبیه‌سازی و مجازی‌سازی برنامه‌های کاربردی در محیط‌های کانتینری برای توسعه و ارزیابی سیستم‌های توزیع‌شده.

11. SimGrid

• شبیه‌ساز برای سیستم‌های توزیع‌شده و رایانش شبکه‌ای، مناسب برای تحلیل و بهینه‌سازی سیستم‌های محاسباتی بزرگ.

12. J-Sim

• شبیه‌ساز برای سیستم‌های شبکه‌ای و رایانش توزیع‌شده، مناسب برای تحقیق در زمینه شبکه‌های کامپیوتری.

13. QualNet

• شبیه‌ساز شبکه‌های ارتباطی برای تحلیل و ارزیابی عملکرد شبکه‌های بزرگ و پیچیده.

14. PeerSim

• شبیه‌ساز شبکه‌های همتا به همتا (P2P) برای تحقیق در زمینه الگوریتم‌های توزیع‌شده و سیستم‌های P2P.

15. P2Psim

• شبیه‌ساز ویژه برای شبکه‌های همتا به همتا (P2P) جهت تحلیل و ارزیابی عملکرد شبکه‌های P2P.

16. Arena

• شبیه‌ساز سیستم‌های رویداد محور برای تحلیل و بهینه‌سازی سیستم‌های کامپیوتری و صنعتی.

17. AnyLogic

• شبیه‌ساز چندگانه برای سیستم‌های ترکیبی، شبیه‌سازی سیستم‌های پیچیده و فرآیندهای کسب و کار.

18. GridSim

• شبیه‌ساز برای شبکه‌های رایانش گرید و ارزیابی عملکرد سیستم‌های محاسباتی گرید.

19. NetSim

• شبیه‌ساز برای شبکه‌های مخابراتی و ارزیابی عملکرد شبکه‌های بی‌سیم، مخابراتی و سنسوری.

20. TOSSIM

• شبیه‌ساز برای شبکه‌های حسگر بی‌سیم و توسعه برنامه‌های کاربردی در سیستم‌های تعبیه‌شده و IoT.

این شبیه‌سازها بسته به حوزه تحقیقاتی در مهندسی کامپیوتر (مانند شبکه‌های کامپیوتری، رایانش ابری، اینترنت اشیا، سیستم‌های توزیع‌شده و غیره) می‌توانند بسیار مفید و کارآمد باشند.